آزمایشگاه جامع تحقیقات بر گزار کرد 

کارگاه آموزشی «کاربرد پایگاه GEO در مطالعات بیوانفورماتیک: از جستجوی داده تا تحلیل بیان ژن» با هدف ارتقای توانمندی‌های پژوهشی دانشجویان تحصیلات تکمیلی و آشنایی آنان با ظرفیت پایگاه‌های داده عمومی در مطالعات زیست‌پزشکی و تحلیل‌های بیوانفورماتیکی در محل آزمایشگاه جامع تحقیقات دانشگاه علوم پزشکی نیشابور  برگزار شد.
این کارگاه با تمرکز بر معرفی و کاربرد پایگاه Gene Expression Omnibus (GEO)، به آموزش فرآیند استفاده از داده‌های عمومی بیان ژن در مسیر انجام پژوهش‌های نوین زیست‌پزشکی پرداخت. در این برنامه، شرکت‌کنندگان با ساختار داده‌های موجود در پایگاه GEO، نحوه جستجو و انتخاب Datasetهای مناسب، انواع داده‌های بیان ژن و روش‌های دریافت و آماده‌سازی داده‌ها آشنا شدند.
در ادامه مباحث تخصصی شامل تحلیل بیان ژن با استفاده از ابزار GEO2R، شناسایی ژن‌های با بیان متفاوت (Differentially Expressed Genes)، بررسی و تفسیر نتایج با بهره‌گیری از نمودارهای Volcano Plot، Heatmap و PCA ارائه شد. همچنین تحلیل‌های عملکردی شامل Gene Ontology (GO)، بررسی مسیرهای زیستی KEGG و تحلیل شبکه تعاملات پروتئین–پروتئین (PPI) مورد بررسی قرار گرفت.
در بخش پایانی این کارگاه، روند انجام یک مطالعه موردی منتشرشده از مرحله انتخاب داده‌های مناسب تا تحلیل و تفسیر نهایی نتایج تشریح شد و نقش داده‌های عمومی زیستی در شناسایی بیومارکرهای جدید، بررسی مکانیسم‌های مولکولی بیماری‌ها و دستیابی به اهداف درمانی بالقوه مورد تأکید قرار گرفت.
برگزاری این کارگاه در راستای توسعه مهارت‌های پژوهشی، تقویت رویکردهای نوین تحلیل داده‌های اُمیکس و آشنایی دانشجویان با ابزارهای کاربردی بیوانفورماتیک انجام شد و با استقبال شرکت‌کنندگان، تبادل نظر و پاسخ‌گویی به پرسش‌های تخصصی پیرامون کاربرد این روش‌ها در تحقیقات زیست‌پزشکی به پایان رسید.

نوشتن دیدگاه